Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPRR1BP22528 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms