Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3P10147 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3P10147 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms