Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E9PBE3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E9PBE3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E9PBE3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms