Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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