Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
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ITGB3BPQ13352 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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ITGB3BPQ13352 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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ITGB3BPQ13352 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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ITGB3BPQ13352 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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ITGB3BPQ13352 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
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ITGB3BPQ13352 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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ITGB3BPQ13352 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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ITGB3BPQ13352 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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ITGB3BPQ13352 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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ITGB3BPQ13352 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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ITGB3BPQ13352 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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ITGB3BPQ13352 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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