Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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KCNMA1Q12791 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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KCNMA1Q12791 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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KCNMA1Q12791 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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KCNMA1Q12791 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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KCNMA1Q12791 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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KCNMA1Q12791 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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KCNMA1Q12791 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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KCNMA1Q12791 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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