Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms