Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PI4KAP42356 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms