Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJC1P36383 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJC1P36383 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJC1P36383 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms