Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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