Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms