Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms