Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms