Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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C9orf135Q5VTT2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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C9orf135Q5VTT2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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C9orf135Q5VTT2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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C9orf135Q5VTT2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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C9orf135Q5VTT2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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C9orf135Q5VTT2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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C9orf135Q5VTT2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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C9orf135Q5VTT2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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