Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms