Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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CALCOCO2Q13137 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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CALCOCO2Q13137 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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CALCOCO2Q13137 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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