Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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