Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP107P57740 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP107P57740 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP107P57740 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms