Protein–RNA interactions for Protein: P56880

CLDN20, Claudin-20, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN20P56880 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN20P56880 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms