Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms