Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms