Protein–RNA interactions for Protein: H3BN98

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BN98 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BN98 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BN98 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BN98 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BN98 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BN98 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BN98 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BN98 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BN98 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BN98 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BN98 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BN98 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BN98 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms