Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E9PBE3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E9PBE3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E9PBE3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms