Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
L1RE1Q9UN81 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
L1RE1Q9UN81 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
L1RE1Q9UN81 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
L1RE1Q9UN81 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
L1RE1Q9UN81 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
L1RE1Q9UN81 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
L1RE1Q9UN81 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
L1RE1Q9UN81 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
L1RE1Q9UN81 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
L1RE1Q9UN81 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms