Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0B6

CCDC167, Coiled-coil domain-containing protein 167, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC167Q9P0B6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC167Q9P0B6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC167Q9P0B6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms