Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms