Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PBRM1Q86U86 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PBRM1Q86U86 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PBRM1Q86U86 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PBRM1Q86U86 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PBRM1Q86U86 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PBRM1Q86U86 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PBRM1Q86U86 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PBRM1Q86U86 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PBRM1Q86U86 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PBRM1Q86U86 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PBRM1Q86U86 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PBRM1Q86U86 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PBRM1Q86U86 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PBRM1Q86U86 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms