Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms