Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms