Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms