Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms