Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms