Protein–RNA interactions for Protein: O95947

TBX6, T-box transcription factor TBX6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX6O95947 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBX6O95947 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBX6O95947 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBX6O95947 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBX6O95947 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBX6O95947 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBX6O95947 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBX6O95947 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBX6O95947 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBX6O95947 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBX6O95947 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBX6O95947 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBX6O95947 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBX6O95947 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBX6O95947 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBX6O95947 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBX6O95947 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBX6O95947 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBX6O95947 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBX6O95947 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBX6O95947 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBX6O95947 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBX6O95947 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBX6O95947 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBX6O95947 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBX6O95947 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBX6O95947 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBX6O95947 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBX6O95947 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms