Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms