Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms