Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms