Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms