Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHDC7AQ5VTJ3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms