Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms