Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms