Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms