Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACTA2P62736 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms