Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL3P58215 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms