Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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CASQ1P31415 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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