Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms