Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms