Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERPIND1P05546 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms