Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA1P02647 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOA1P02647 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOA1P02647 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOA1P02647 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOA1P02647 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOA1P02647 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA1P02647 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA1P02647 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA1P02647 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms