Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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