Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms